WOW: Modélisation d'une épidémie

Quand je faisais mon Master en informatique médicale en 2003, il y avait un module où on devrait modéliser la propagation d'une épidémie de sida dans un village africain à l'aide de Scilab(image), un logiciel libre de calcul scientifique. Mais on n'avait pas les moyen de tout calculer et deux plus que le professeur était vraiment pas très sympa. Du coût, il me semblait que cela devrait être un travail ennuyant. Mais voilà pourquoi j'avais tort:

Le Professeur Nina Fefferman et sont équipe, de l'Université de Tufts, ont modélisé une maladie infectieuse fatale sur le jeu virtuel The Word of Warcraft(image). Malgré l'existence des mesures de prévention et de quarantaine, la maladie a propagé et a causé un chaos social au sein du jeu. Ils ont non seulement étudié la propagation du jeu comme un modèle social d'épidémie infectieuse, mais aussi ont étudié le comportement des joueurs par rapport à cette maladie. A ce propos, les chercheurs ont expliqué trois types de comportement:

• Ceux qui partaient à l'aide des autres, sans se faire soucier qu'ils vont eux aussi attraper la maladie. En effet le caractère virtuel du jeu met en avant des comportements à risque -on le sais déjà.
• Ceux qui se sont éloignés des zones infectées.
• Ceux qui ont essayé de rendre malade les autres une fois qu'ils ont attrapé la maladie.

De point de vue technique, cette expérience était très intéressante. Car elle a permis d'inclure les comportements réels des individus devant une maladie, car les joueurs décident chacun personnellement pour son avatar. Ainsi, nous sommes plus proches de la réalité dans cet expérience que dans les modèles mathématiques classiques où on ne peut que modéliser ce comportement d'après nos observations du passé.

Pas mal, non?

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Lire l'article sur BBC (en anglais)

SHAKESPEARE IN LOVE

Après avoir quitté sa femme et ses enfant à Stratford, et ayant déjà obtenu un certain titre de Master Shakespear, le jeune écrivain se trouve sans inspiration amoureuse pour écrire une nouvelle pièce. En quête d'amour, il rencontre Lady Viola une jeune dame de la bourgeoisie londonienne qui aime bien le théâtre. S'inspirant de cet amour sans but (car les deux sont mariés) il écrit Roméo et Juliette.

Un film de John Madden réalisé en 1998 qui a gagné en 1999 plusieurs Oscar dont meilleur film, meilleur scénario original, meilleur actrice(Gwineth Palthrow), meilleur second rôle féminin (Judy Dench) et meilleur direction artistique. Il a été récompensé également dans Golden Globe et Grammy Awards.

Pour un film ayant gagné autant de prix, je peux dire que j'ai été plutôt déçu. Mais il faut savoir aussi qu'avoir gagné beaucoup de prix ne veut rien dire, car cela dépend des autres concourant. Il y a des années où le meilleur film est moins bien que les films des années précédentes. Les scènes sont plutôt modeste, et les dialogues perdent leur rythme devant les paroles emprunté de l'oeuvre originale du Maître Shakespeare. Quelques personnage comme celui du garçon errant qui joue avec (ou vend) des souris ne sont pas développés; et surtout les effets spéciaux du film sont naïfs, comme l'accélération du film lors du combat de Shakespeare avec Wessex.
Comme beaucoup de films américain, il y a encore des personnage tout noir, ou tout blanc avec des contradictions qui peuvent être considérées comme des fautes dans une école française du cinéma: Shakespeare, le protagoniste du film est un homme parfait. Il fait tout bien: la littérature, la poésie, l'amour, le combat et la prière. Quand il se déguise comme une femme dans la court de Queen Elizabeth, il ose même parler et personne, y compris l'intelligente et brillante reine Angleterre ne soupçonne de rien. Au contraire, lord Wessex, son antagoniste, lui, il ne sait rien faire. Même quand il croit avoir tué Shakespeare, il se rend compte qu'il a tué Christophe Marlow.
Les scènes sont plutôt théâtrales et n'arrive pas à emporter l'audience dans l'intrigue. Si vous avez déjà lu Shakespeare et vous aimez ses pièces, contrairement à ce que vous attendez, ce film va vous décevoir. Par contre, si vous aimez Danielle Steel, vous allez aimez cette histoire!
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La fiche techniques du film Shakespear in love dans IMDb

TANAGRA pour Data Mining

TANAGRA est un logiciel gratuit de Data mining destiné à l’enseignement et à la recherche. Il implémente une série de méthodes de fouille de données issues du domaine de la statistique exploratoire, de l'analyse de données, de l’apprentissage automatique et des bases de données.

C'est un projet ouvert au sens qu'il est possible à tout chercheur d'accéder au code, d'ajouter ses propres algorithmes et de diffuser, toujours gratuitement, le logiciel modifié.

Finalement, Tanagra est aussi le nom d'un cité grècque d'où vient la statuette que vous voyez ici.

(Source: Wikipédia)

Si vous n'avez pas les moyens pharamineux de vous acheter un logiciel commercial tel que Clémentine, et que vous ne pouvez pas vous donnez la peine d'apprendre le language de programmation R, c'est une bonne solution pur vous.

Il vous permet de faire un peu tous que l'on fait en statistiques: les méthodes univariés et multivariés, les cartes topologique et les l'apprentissage supervisé.

Ce qui est bien, c'est que le code source est ouvert et gratuit, et donc - comme son concépteur Ricco RAKOTOMALALA l'indique, c'est un vrai laboratoire pour appredre à la fois la statistique, l'appretinssage artificeil et la programmation en Delphi.

Je l'ai installé, et il a fonctionné sans bug - ce qui est déjà bien pour un logiciel libre- mais je l'ai pas testé complètement. Finalement, je ne sais pas pourquoi ce projet est un peu abandonné, et qu'il n'y a pas de communauté autour. Il peut faire un logiciel libre contre la présence monopole de Clémentine.

Un petit bémol: le choix du langage de programamtion. Je pense que s'il était écrit en Java ou Python, il aurait pu mieu s'équiper d'une communaté de soutien, chose qu'il ne semble pas être le cas en ce moment. Mais en tout cas, bravo pour l'idée et la conception.

Lien vers le site du Tanagra

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QUE VOUS LE CROYEZ OU PAS!

Quand je suis venu en France en 2002, j'ai trouvé que les médecins français étaient beaucoup moins branchés aux informatiques en France qu'en Iran. La preuve, en 2002 j'avais déjà mon premier poste de Blog sur Blogger, et je possédais mon email depuis 1992.

Mais!...Mais en espace de 5 ans, je vois multiplié le nombre des médecins utilisant des outils en informatique médicale en France, grâce à ses infrastructure informatique robuste, et encore grâce à l'ADSL qui est désormais un phénomène nouveau en Iran. Ceci dit, en ce qui concerne les blogs, les iraniens sont eux aussi restés parmi les nations les plus blogueurs du monde (4ème en 2006).

En tout cas, la raison pour laquelle je reviens blogger après 5 ans n'est pas comparer mon pays natale avec mon pays adoptif, mais il y a bien d'autre raison:

1. J'ai appris le français, donc je me permets d'écrire en français, alors qu'avant j'écrivais mon blog en persan (j'ai d'ailleurs perdu tous mes postes!).


2. J'ai fait mes études en informatique médicale, donc cette conviction informatique m'oblige de m'exprimer en utilisant les outils informatique.


3. Je pense que le temps est arriver pour que je recommence à philosopher, comme je le faisait avant d'arriver en France, car j'en ai marre de cette vie boulot,métro,dodo.


4. Je trouve un peu plus de temps en ce mois d'août où il fait tout sauf beau, et grâce à ça, je travaille mon imaginaire plus que quand il fait beau!

Qu'est-ce que je vais faire?

Et bin, je vais écrire tous les jours, sur la médecine, l'informatique médicale, la philosophie, la politique, et tous ce qui me semble interessant.

A plus